《特别使命》是一部描写高智商犯罪的电视剧。东江骗税案频发，省公安厅成立专案组秘密赶赴东江。因使命特殊，贺北声(蒋恺 饰)受命以贸易公司老板身份进驻东江担任专案组组长，不料，刚到东江便引起刑警队长常蒙(刘冠霖 饰)的怀疑而被盯上。贺北声跟实名举报人柳大志(岳跃利 饰)见面，不料，柳大志却被人先一步灭口。贺北声为救柳大志之女柳麦(夏一瑶 饰)，与凶犯交手刺伤对手，但未能及时离开现场，被随后赶来的常蒙误为杀手。贺北声的身份被证实，常蒙还被限期侦破凶杀案，并且，还多加了一项任务——配合专案组侦破东江骗税案。骗税集团首犯林冰(胡东 饰)为断线索将知情者灭口，在此关口，与林冰有过节的王可之(梁国荣 饰)趁机暗中陷害，派人举报林冰有骗税嫌疑，林冰被专案组锁定陷入危机之中……